Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN13Q12923 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN13Q12923 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN13Q12923 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPN13Q12923 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN13Q12923 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN13Q12923 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN13Q12923 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN13Q12923 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN13Q12923 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN13Q12923 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN13Q12923 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN13Q12923 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN13Q12923 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN13Q12923 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN13Q12923 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN13Q12923 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN13Q12923 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN13Q12923 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN13Q12923 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN13Q12923 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN13Q12923 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN13Q12923 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN13Q12923 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN13Q12923 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN13Q12923 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPN13Q12923 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN13Q12923 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN13Q12923 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN13Q12923 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN13Q12923 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN13Q12923 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN13Q12923 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN13Q12923 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN13Q12923 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN13Q12923 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN13Q12923 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN13Q12923 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN13Q12923 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPN13Q12923 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPN13Q12923 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN13Q12923 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN13Q12923 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN13Q12923 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN13Q12923 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN13Q12923 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN13Q12923 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN13Q12923 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN13Q12923 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN13Q12923 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN13Q12923 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN13Q12923 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN13Q12923 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN13Q12923 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN13Q12923 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN13Q12923 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN13Q12923 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN13Q12923 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN13Q12923 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN13Q12923 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN13Q12923 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN13Q12923 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN13Q12923 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN13Q12923 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN13Q12923 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN13Q12923 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN13Q12923 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN13Q12923 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN13Q12923 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN13Q12923 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN13Q12923 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN13Q12923 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN13Q12923 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN13Q12923 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN13Q12923 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN13Q12923 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN13Q12923 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN13Q12923 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN13Q12923 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN13Q12923 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN13Q12923 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN13Q12923 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN13Q12923 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN13Q12923 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN13Q12923 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN13Q12923 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN13Q12923 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN13Q12923 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN13Q12923 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN13Q12923 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
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