Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RBL2Q08999 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RBL2Q08999 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RBL2Q08999 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RBL2Q08999 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RBL2Q08999 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RBL2Q08999 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RBL2Q08999 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RBL2Q08999 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RBL2Q08999 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RBL2Q08999 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RBL2Q08999 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RBL2Q08999 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RBL2Q08999 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RBL2Q08999 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RBL2Q08999 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RBL2Q08999 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RBL2Q08999 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RBL2Q08999 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RBL2Q08999 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RBL2Q08999 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RBL2Q08999 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RBL2Q08999 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RBL2Q08999 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RBL2Q08999 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RBL2Q08999 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RBL2Q08999 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RBL2Q08999 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RBL2Q08999 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RBL2Q08999 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RBL2Q08999 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RBL2Q08999 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RBL2Q08999 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RBL2Q08999 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RBL2Q08999 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RBL2Q08999 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RBL2Q08999 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RBL2Q08999 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBL2Q08999 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RBL2Q08999 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RBL2Q08999 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RBL2Q08999 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RBL2Q08999 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RBL2Q08999 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RBL2Q08999 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RBL2Q08999 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RBL2Q08999 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RBL2Q08999 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RBL2Q08999 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RBL2Q08999 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RBL2Q08999 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RBL2Q08999 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RBL2Q08999 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RBL2Q08999 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RBL2Q08999 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RBL2Q08999 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RBL2Q08999 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RBL2Q08999 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RBL2Q08999 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RBL2Q08999 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RBL2Q08999 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RBL2Q08999 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RBL2Q08999 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RBL2Q08999 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RBL2Q08999 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBL2Q08999 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RBL2Q08999 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RBL2Q08999 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBL2Q08999 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBL2Q08999 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBL2Q08999 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RBL2Q08999 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RBL2Q08999 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBL2Q08999 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBL2Q08999 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RBL2Q08999 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RBL2Q08999 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
RBL2Q08999 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RBL2Q08999 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
RBL2Q08999 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RBL2Q08999 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RBL2Q08999 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RBL2Q08999 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
RBL2Q08999 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RBL2Q08999 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RBL2Q08999 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RBL2Q08999 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RBL2Q08999 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RBL2Q08999 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RBL2Q08999 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RBL2Q08999 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RBL2Q08999 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RBL2Q08999 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
RBL2Q08999 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RBL2Q08999 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RBL2Q08999 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
RBL2Q08999 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RBL2Q08999 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RBL2Q08999 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RBL2Q08999 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms