Protein–RNA interactions for Protein: P78559

MAP1A, Microtubule-associated protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1AP78559 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP1AP78559 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP1AP78559 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP1AP78559 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP1AP78559 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP1AP78559 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP1AP78559 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP1AP78559 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP1AP78559 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP1AP78559 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MAP1AP78559 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP1AP78559 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP1AP78559 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP1AP78559 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP1AP78559 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MAP1AP78559 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAP1AP78559 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MAP1AP78559 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP1AP78559 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP1AP78559 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP1AP78559 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP1AP78559 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP1AP78559 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP1AP78559 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP1AP78559 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP1AP78559 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAP1AP78559 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP1AP78559 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAP1AP78559 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP1AP78559 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP1AP78559 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP1AP78559 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP1AP78559 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAP1AP78559 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAP1AP78559 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAP1AP78559 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP1AP78559 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP1AP78559 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP1AP78559 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP1AP78559 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP1AP78559 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP1AP78559 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP1AP78559 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAP1AP78559 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP1AP78559 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP1AP78559 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP1AP78559 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP1AP78559 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP1AP78559 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP1AP78559 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP1AP78559 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP1AP78559 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP1AP78559 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP1AP78559 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP1AP78559 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP1AP78559 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP1AP78559 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP1AP78559 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP1AP78559 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP1AP78559 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP1AP78559 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP1AP78559 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP1AP78559 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP1AP78559 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP1AP78559 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP1AP78559 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP1AP78559 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP1AP78559 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP1AP78559 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP1AP78559 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP1AP78559 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAP1AP78559 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP1AP78559 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAP1AP78559 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP1AP78559 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAP1AP78559 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAP1AP78559 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms