Protein–RNA interactions for Protein: P11717

IGF2R, Cation-independent mannose-6-phosphate receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2RP11717 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGF2RP11717 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGF2RP11717 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IGF2RP11717 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGF2RP11717 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IGF2RP11717 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IGF2RP11717 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGF2RP11717 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IGF2RP11717 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGF2RP11717 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGF2RP11717 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGF2RP11717 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGF2RP11717 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGF2RP11717 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGF2RP11717 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGF2RP11717 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGF2RP11717 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGF2RP11717 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGF2RP11717 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGF2RP11717 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGF2RP11717 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGF2RP11717 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
IGF2RP11717 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGF2RP11717 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGF2RP11717 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGF2RP11717 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGF2RP11717 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGF2RP11717 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGF2RP11717 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGF2RP11717 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IGF2RP11717 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGF2RP11717 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGF2RP11717 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGF2RP11717 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGF2RP11717 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGF2RP11717 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGF2RP11717 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGF2RP11717 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGF2RP11717 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGF2RP11717 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGF2RP11717 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGF2RP11717 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGF2RP11717 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IGF2RP11717 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IGF2RP11717 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IGF2RP11717 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGF2RP11717 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IGF2RP11717 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IGF2RP11717 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IGF2RP11717 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGF2RP11717 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IGF2RP11717 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGF2RP11717 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IGF2RP11717 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGF2RP11717 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IGF2RP11717 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGF2RP11717 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGF2RP11717 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGF2RP11717 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IGF2RP11717 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGF2RP11717 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGF2RP11717 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IGF2RP11717 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGF2RP11717 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGF2RP11717 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
IGF2RP11717 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGF2RP11717 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGF2RP11717 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGF2RP11717 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGF2RP11717 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGF2RP11717 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGF2RP11717 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGF2RP11717 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
IGF2RP11717 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGF2RP11717 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGF2RP11717 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGF2RP11717 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGF2RP11717 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGF2RP11717 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGF2RP11717 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGF2RP11717 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGF2RP11717 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGF2RP11717 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
IGF2RP11717 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGF2RP11717 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGF2RP11717 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGF2RP11717 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGF2RP11717 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGF2RP11717 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGF2RP11717 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms