Protein–RNA interactions for Protein: B5MCH6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B5MCH6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B5MCH6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B5MCH6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B5MCH6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
B5MCH6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
B5MCH6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
B5MCH6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
B5MCH6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B5MCH6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B5MCH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
B5MCH6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
B5MCH6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B5MCH6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B5MCH6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B5MCH6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B5MCH6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B5MCH6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
B5MCH6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B5MCH6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B5MCH6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B5MCH6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
B5MCH6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
B5MCH6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
B5MCH6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
B5MCH6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
B5MCH6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
B5MCH6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
B5MCH6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
B5MCH6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
B5MCH6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
B5MCH6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
B5MCH6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
B5MCH6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B5MCH6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B5MCH6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
B5MCH6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B5MCH6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B5MCH6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B5MCH6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B5MCH6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B5MCH6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B5MCH6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B5MCH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B5MCH6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B5MCH6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B5MCH6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B5MCH6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B5MCH6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B5MCH6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B5MCH6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B5MCH6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B5MCH6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B5MCH6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B5MCH6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B5MCH6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B5MCH6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B5MCH6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B5MCH6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B5MCH6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B5MCH6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B5MCH6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B5MCH6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B5MCH6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B5MCH6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B5MCH6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
B5MCH6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B5MCH6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
B5MCH6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
B5MCH6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
B5MCH6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B5MCH6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
B5MCH6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B5MCH6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B5MCH6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B5MCH6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B5MCH6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B5MCH6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B5MCH6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B5MCH6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B5MCH6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B5MCH6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B5MCH6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B5MCH6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B5MCH6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B5MCH6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B5MCH6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B5MCH6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B5MCH6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B5MCH6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B5MCH6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B5MCH6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B5MCH6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
B5MCH6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B5MCH6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B5MCH6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B5MCH6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B5MCH6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B5MCH6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B5MCH6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B5MCH6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms