Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23IPQ9Y6Y8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC23IPQ9Y6Y8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms