Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3HQ9Y535 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3HQ9Y535 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3HQ9Y535 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms