Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PARP4Q9UKK3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PARP4Q9UKK3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PARP4Q9UKK3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PARP4Q9UKK3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms