Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM7Q9UK45 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM7Q9UK45 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM7Q9UK45 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms