Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms