Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DKK2Q9UBU2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms