Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNFX1Q9P2E3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNFX1Q9P2E3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNFX1Q9P2E3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNFX1Q9P2E3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNFX1Q9P2E3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNFX1Q9P2E3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNFX1Q9P2E3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNFX1Q9P2E3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNFX1Q9P2E3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms