Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSKIPQ9P0R6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GSKIPQ9P0R6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms