Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM9Q9NQV7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms