Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK3Q9C098 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK3Q9C098 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms