Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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