Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDA1Q9BW61 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDA1Q9BW61 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms