Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPS25Q9BRG1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS25Q9BRG1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS25Q9BRG1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms