Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED2Q99967 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms