Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNL2Q96S94 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNL2Q96S94 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNL2Q96S94 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNL2Q96S94 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNL2Q96S94 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNL2Q96S94 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNL2Q96S94 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL2Q96S94 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms