Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRAC1Q96KF2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PRAC1Q96KF2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms