Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC120Q96HB5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC120Q96HB5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC120Q96HB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms