Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSANTD3Q96H12 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSANTD3Q96H12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD3Q96H12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD3Q96H12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms