Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN37Q96GY3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN37Q96GY3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms