Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP28Q8NHY6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP28Q8NHY6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP28Q8NHY6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms