Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC84Q86UT8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms