Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z494

NPHP3, Nephrocystin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3Q7Z494 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPHP3Q7Z494 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NPHP3Q7Z494 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NPHP3Q7Z494 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NPHP3Q7Z494 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NPHP3Q7Z494 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NPHP3Q7Z494 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPHP3Q7Z494 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NPHP3Q7Z494 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 655.1 ms