Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCBE1Q6UXH8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.7 ms