Protein–RNA interactions for Protein: Q68D10

SPTY2D1, Protein SPT2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1Q68D10 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SPTY2D1Q68D10 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTY2D1Q68D10 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTY2D1Q68D10 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms