Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPDYAQ5MJ70 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPDYAQ5MJ70 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDYAQ5MJ70 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms