Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ODF2Q5BJF6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ODF2Q5BJF6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1214.5 ms