Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAN3Q58A45 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAN3Q58A45 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms