Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A9Q2M3M2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A9Q2M3M2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A9Q2M3M2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A9Q2M3M2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms