Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYTH1Q15438 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYTH1Q15438 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH1Q15438 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms