Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-214ENST00000581418 580 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-209ENST00000578642 579 ntTSL 416.86■□□□□ 0.292e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-221ENST00000583961 581 ntTSL 516.82■□□□□ 0.282e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.252e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.242e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-212ENST00000580716 567 ntTSL 416.45■□□□□ 0.222e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-216ENST00000582327 561 ntTSL 416.45■□□□□ 0.222e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-224ENST00000584460 1855 ntTSL 216.18■□□□□ 0.182e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 CAPN1-205ENST00000526954 754 ntTSL 515.95■□□□□ 0.142e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-207ENST00000578392 552 ntTSL 415.6■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-213ENST00000580723 594 ntTSL 415.31■□□□□ 0.042e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-210ENST00000580141 924 ntTSL 514.67□□□□□ -0.062e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-211ENST00000580627 543 ntTSL 414.61□□□□□ -0.072e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-219ENST00000583641 795 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 CAPN1-213ENST00000527897 879 ntTSL 314.53□□□□□ -0.082e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-203ENST00000392357 4076 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.252e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-215ENST00000581578 470 ntTSL 412.36□□□□□ -0.432e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.442e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-217ENST00000583009 574 ntTSL 411.63□□□□□ -0.552e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 GPS1-220ENST00000583885 594 ntTSL 411.61□□□□□ -0.552e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 CAPN1-204ENST00000526468 690 ntTSL 310.71□□□□□ -0.692e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 ARHGEF10L-205ENST00000466782 482 ntTSL 39.07□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.652e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.782e-12■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.195e-9■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.765e-9■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.685e-9■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 CHD9-208ENST00000563410 488 ntTSL 219.28■□□□□ 0.688e-13■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 VPS53-215ENST00000573028 3204 ntTSL 216.74■□□□□ 0.275e-9■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 VPS53-220ENST00000576149 2444 ntTSL 59.96□□□□□ -0.825e-9■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 VPS53-202ENST00000389040 1903 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.835e-9■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 VPS53-203ENST00000401468 1269 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -15e-9■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.315e-9■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 TLK1-204ENST00000413010 603 ntTSL 515.41■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 51.4
PCBP2Q15366 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-12■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.012e-12■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.992e-12■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 517.99■□□□□ 0.472e-12■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 MERTK-201ENST00000295408 3954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 MERTK-203ENST00000421804 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 MERTK-207ENST00000616902 3104 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 MERTK-204ENST00000439966 2972 ntTSL 1 (best)10.19□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 MERTK-202ENST00000409780 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 AL139383.1-201ENST00000454681 892 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.464e-33■■■■■ 51.3
PCBP2Q15366 STK39-203ENST00000487143 2214 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.363e-35■■■■■ 51.2
PCBP2Q15366 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 51.2
PCBP2Q15366 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 51.2
PCBP2Q15366 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 27.18□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 51.2
PCBP2Q15366 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 51.2
PCBP2Q15366 CDK19-204ENST00000457688 955 ntTSL 510.02□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 51.2
PCBP2Q15366 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 51.2
PCBP2Q15366 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 51.2
PCBP2Q15366 CDK19-206ENST00000463016 604 ntTSL 53.91□□□□□ -1.782e-7■■■■■ 51.2
PCBP2Q15366 CMIP-204ENST00000561605 407 ntTSL 510.08□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 RSPRY1-205ENST00000562768 585 ntTSL 46.39□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 MAT2A-203ENST00000465151 583 ntTSL 29.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 MAT2A-204ENST00000469221 691 ntTSL 26.72□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 221.28■■□□□ 18e-7■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.049e-15■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.179e-15■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 RBM47-207ENST00000510871 4951 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.319e-15■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.329e-15■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 523.61■■□□□ 1.379e-7■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 ARIH1-206ENST00000564062 612 ntTSL 329.81■■■□□ 2.366e-7■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 ARIH1-210ENST00000570085 807 ntTSL 328.16■■■□□ 2.16e-7■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 ARIH1-209ENST00000567762 319 ntTSL 34.23□□□□□ -1.736e-7■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 ATP2A2-207ENST00000548169 2951 ntTSL 29.45□□□□□ -0.93e-11■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 ATP2A2-209ENST00000550248 544 ntTSL 47.58□□□□□ -1.23e-11■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.094e-10■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.654e-10■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 AKAP9-214ENST00000493453 6020 ntTSL 28.94□□□□□ -0.984e-10■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.594e-10■■■■■ 51.1
PCBP2Q15366 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 51
PCBP2Q15366 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 516.33■□□□□ 0.22e-16■■■■■ 51
PCBP2Q15366 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.048e-13■■■■■ 50.9
PCBP2Q15366 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.358e-13■■■■■ 50.9
PCBP2Q15366 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.185e-19■■■■■ 50.9
PCBP2Q15366 DLEU1-230ENST00000489542 780 ntTSL 1 (best)6.55□□□□□ -1.362e-11■■■■■ 50.9
PCBP2Q15366 DLEU1-205ENST00000463357 274 ntTSL 1 (best)5.62□□□□□ -1.512e-11■■■■■ 50.9
PCBP2Q15366 NCOR2-214ENST00000453428 674 ntTSL 59.08□□□□□ -0.962e-17■■■■■ 50.9
PCBP2Q15366 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 50.8
PCBP2Q15366 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 50.8
PCBP2Q15366 C20orf96-201ENST00000360321 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 50.8
PCBP2Q15366 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.123e-10■■■■■ 50.8
PCBP2Q15366 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.273e-10■■■■■ 50.8
PCBP2Q15366 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 511.08□□□□□ -0.646e-9■■■■■ 50.8
PCBP2Q15366 PRKCZ-207ENST00000466651 425 ntTSL 511.16□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 50.8
PCBP2Q15366 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 50.7
PCBP2Q15366 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 27.39□□□□□ -1.233e-9■■■■■ 50.7
PCBP2Q15366 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.258e-13■■■■■ 50.7
PCBP2Q15366 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 521.16■□□□□ 0.984e-13■■■■■ 50.7
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