RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356239.7

AKAP9-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP9, Length 12,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-201ENST00000356239 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.98□□□□□ -0.97
AKAP9-201ENST00000356239 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.96□□□□□ -0.97
AKAP9-201ENST00000356239 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.77□□□□□ -1.01
AKAP9-201ENST00000356239 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
AKAP9-201ENST00000356239 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.61□□□□□ -1.03
AKAP9-201ENST00000356239 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
AKAP9-201ENST00000356239 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.28□□□□□ -1.08
AKAP9-201ENST00000356239 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
AKAP9-201ENST00000356239 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
AKAP9-201ENST00000356239 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
AKAP9-201ENST00000356239 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
AKAP9-201ENST00000356239 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
AKAP9-201ENST00000356239 TRIM41Q8WV44 630 aa7.96□□□□□ -1.14
AKAP9-201ENST00000356239 APLP2Q06481 763 aa7.95□□□□□ -1.14
AKAP9-201ENST00000356239 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.91□□□□□ -1.14
AKAP9-201ENST00000356239 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
AKAP9-201ENST00000356239 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
AKAP9-201ENST00000356239 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
AKAP9-201ENST00000356239 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
AKAP9-201ENST00000356239 HRCP23327 699 aa7.8□□□□□ -1.16
AKAP9-201ENST00000356239 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
AKAP9-201ENST00000356239 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
AKAP9-201ENST00000356239 CHIC1Q5VXU3 224 aa7.72□□□□□ -1.17
AKAP9-201ENST00000356239 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.72□□□□□ -1.17
AKAP9-201ENST00000356239 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
AKAP9-201ENST00000356239 ITGAEP38570 1179 aa7.71□□□□□ -1.18
AKAP9-201ENST00000356239 SCRIBQ14160 1630 aa7.7□□□□□ -1.18
AKAP9-201ENST00000356239 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
AKAP9-201ENST00000356239 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
AKAP9-201ENST00000356239 ABCC9O60706 1549 aa7.61□□□□□ -1.19
AKAP9-201ENST00000356239 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
AKAP9-201ENST00000356239 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.6□□□□□ -1.19
AKAP9-201ENST00000356239 NEFLP07196 543 aa7.59□□□□□ -1.19
AKAP9-201ENST00000356239 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.59□□□□□ -1.19
AKAP9-201ENST00000356239 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.58□□□□□ -1.2
AKAP9-201ENST00000356239 MYT1Q01538 1121 aa7.57□□□□□ -1.2
AKAP9-201ENST00000356239 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.52□□□□□ -1.21
AKAP9-201ENST00000356239 BCANQ96GW7 911 aa7.48□□□□□ -1.21
AKAP9-201ENST00000356239 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
AKAP9-201ENST00000356239 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
AKAP9-201ENST00000356239 NEUROD1Q13562 356 aa7.46□□□□□ -1.22
AKAP9-201ENST00000356239 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
AKAP9-201ENST00000356239 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.38□□□□□ -1.23
AKAP9-201ENST00000356239 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
AKAP9-201ENST00000356239 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.36□□□□□ -1.23
AKAP9-201ENST00000356239 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
AKAP9-201ENST00000356239 ARID3CA6NKF2 412 aa7.35□□□□□ -1.23
AKAP9-201ENST00000356239 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
AKAP9-201ENST00000356239 P3H3Q8IVL6 736 aa7.33□□□□□ -1.24
AKAP9-201ENST00000356239 TRIM52Q96A61 297 aa7.33□□□□□ -1.24
AKAP9-201ENST00000356239 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
AKAP9-201ENST00000356239 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
AKAP9-201ENST00000356239 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.32□□□□□ -1.24
AKAP9-201ENST00000356239 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
AKAP9-201ENST00000356239 WIZO95785 1651 aa7.28□□□□□ -1.24
AKAP9-201ENST00000356239 BCL11AQ9H165 835 aa7.28□□□□□ -1.24
AKAP9-201ENST00000356239 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.25□□□□□ -1.25
AKAP9-201ENST00000356239 ANP32CO43423 234 aa7.24□□□□□ -1.25
AKAP9-201ENST00000356239 FBLN2P98095 1184 aa7.23□□□□□ -1.25
AKAP9-201ENST00000356239 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
AKAP9-201ENST00000356239 ABCC8Q09428 1581 aa7.23□□□□□ -1.25
AKAP9-201ENST00000356239 FKBP8Q14318 412 aa7.22□□□□□ -1.25
AKAP9-201ENST00000356239 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 MIER1Q8N108 512 aa7.18□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.16□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 CEP162Q5TB80 1403 aa7.15□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 NBR1Q14596 966 aa7.15□□□□□ -1.26
AKAP9-201ENST00000356239 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.15□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.15□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 SLC24A1O60721 1099 aa7.12□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 TONSLQ96HA7 1378 aa7.11□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.11□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 CLIP1P30622 1438 aa7.11□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 ARXQ96QS3 562 aa7.09□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 NACADO15069 1562 aa7.09□□□□□ -1.27
AKAP9-201ENST00000356239 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.08□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 GOLGA3Q08378 1498 aa7.08□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.05□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 SOGA1O94964 1423 aa7.04□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.04□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.03□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 PRDM2Q13029 1718 aa7.03□□□□□ -1.28
AKAP9-201ENST00000356239 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.284e-7■■■□□ 17.3
AKAP9-201ENST00000356239 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.02□□□□□ -1.29
AKAP9-201ENST00000356239 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.01□□□□□ -1.29
AKAP9-201ENST00000356239 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.01□□□□□ -1.29
AKAP9-201ENST00000356239 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms