RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578552.5

GPS1-208, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPS1, Length 1,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-208ENST00000578552 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.1■■■■□ 3.69
GPS1-208ENST00000578552 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.43■■■□□ 2.94
GPS1-208ENST00000578552 ABCC9O60706 1549 aa32.28■■■□□ 2.76
GPS1-208ENST00000578552 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
GPS1-208ENST00000578552 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.76■■■□□ 2.68
GPS1-208ENST00000578552 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.35■■■□□ 2.61
GPS1-208ENST00000578552 NACADO15069 1562 aa31.21■■■□□ 2.59
GPS1-208ENST00000578552 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.13■■■□□ 2.57
GPS1-208ENST00000578552 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.12■■■□□ 2.57
GPS1-208ENST00000578552 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.93■■■□□ 2.54
GPS1-208ENST00000578552 SCRIBQ14160 1630 aa30.86■■■□□ 2.53
GPS1-208ENST00000578552 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.71■■■□□ 2.51
GPS1-208ENST00000578552 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.35■■■□□ 2.452e-7■■■□□ 16.2
GPS1-208ENST00000578552 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.33■■■□□ 2.45
GPS1-208ENST00000578552 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.78■■■□□ 2.36
GPS1-208ENST00000578552 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.51■■■□□ 2.31
GPS1-208ENST00000578552 SMARCA4P51532 1647 aa29.45■■■□□ 2.3
GPS1-208ENST00000578552 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
GPS1-208ENST00000578552 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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GPS1-208ENST00000578552 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
GPS1-208ENST00000578552 WIZO95785 1651 aa29.29■■■□□ 2.28
GPS1-208ENST00000578552 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.15■■■□□ 2.26
GPS1-208ENST00000578552 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.06■■■□□ 2.24
GPS1-208ENST00000578552 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.02■■■□□ 2.24
GPS1-208ENST00000578552 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.01■■■□□ 2.23
GPS1-208ENST00000578552 SMARCA2P51531 1590 aa28.95■■■□□ 2.22
GPS1-208ENST00000578552 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
GPS1-208ENST00000578552 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GPS1-208ENST00000578552 NCAPD3P42695 1498 aa28.81■■■□□ 2.2
GPS1-208ENST00000578552 HMGXB3Q12766 1538 aa28.76■■■□□ 2.19
GPS1-208ENST00000578552 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.57■■■□□ 2.16
GPS1-208ENST00000578552 NESP48681 1621 aa28.21■■■□□ 2.11
GPS1-208ENST00000578552 CFTRP13569 1480 aa28.07■■■□□ 2.08
GPS1-208ENST00000578552 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.07■■■□□ 2.08
GPS1-208ENST00000578552 PRDM2Q13029 1718 aa27.97■■■□□ 2.07
GPS1-208ENST00000578552 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.95■■■□□ 2.07
GPS1-208ENST00000578552 ABCC8Q09428 1581 aa27.93■■■□□ 2.06
GPS1-208ENST00000578552 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.86■■■□□ 2.05
GPS1-208ENST00000578552 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.82■■■□□ 2.04
GPS1-208ENST00000578552 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.78■■■□□ 2.04
GPS1-208ENST00000578552 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.7■■■□□ 2.03
GPS1-208ENST00000578552 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.68■■■□□ 2.02
GPS1-208ENST00000578552 SYNJ1O43426 1573 aa27.67■■■□□ 2.02
GPS1-208ENST00000578552 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
GPS1-208ENST00000578552 ERCC6Q03468 1493 aa27.63■■■□□ 2.01
GPS1-208ENST00000578552 CUX1P39880 1505 aa27.61■■■□□ 2.01
GPS1-208ENST00000578552 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
GPS1-208ENST00000578552 TRIM41Q8WV44 630 aa27.54■■■□□ 2
GPS1-208ENST00000578552 TOP2BQ02880 1626 aa27.49■■□□□ 1.99
GPS1-208ENST00000578552 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.48■■□□□ 1.99
GPS1-208ENST00000578552 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
GPS1-208ENST00000578552 TOPBP1Q92547 1522 aa27.48■■□□□ 1.99
GPS1-208ENST00000578552 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.46■■□□□ 1.99
GPS1-208ENST00000578552 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.45■■□□□ 1.99
GPS1-208ENST00000578552 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.38■■□□□ 1.97
GPS1-208ENST00000578552 WDR62O43379 1518 aa27.35■■□□□ 1.97
GPS1-208ENST00000578552 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
GPS1-208ENST00000578552 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.29■■□□□ 1.96
GPS1-208ENST00000578552 SOGA1O94964 1423 aa27.23■■□□□ 1.95
GPS1-208ENST00000578552 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.23■■□□□ 1.95
GPS1-208ENST00000578552 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
GPS1-208ENST00000578552 CUX2O14529 1486 aa27.21■■□□□ 1.95
GPS1-208ENST00000578552 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
GPS1-208ENST00000578552 WDR97A6NE52 1622 aa27.11■■□□□ 1.93
GPS1-208ENST00000578552 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
GPS1-208ENST00000578552 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.04■■□□□ 1.92
GPS1-208ENST00000578552 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
GPS1-208ENST00000578552 IFT140Q96RY7 1462 aa27■■□□□ 1.91
GPS1-208ENST00000578552 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27■■□□□ 1.91
GPS1-208ENST00000578552 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.913e-8■□□□□ 10.6
GPS1-208ENST00000578552 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.93■■□□□ 1.9
GPS1-208ENST00000578552 KIF27Q86VH2 1401 aa26.92■■□□□ 1.9
GPS1-208ENST00000578552 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
GPS1-208ENST00000578552 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.86■■□□□ 1.89
GPS1-208ENST00000578552 PBRM1Q86U86 1689 aa26.85■■□□□ 1.89
GPS1-208ENST00000578552 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.82■■□□□ 1.88
GPS1-208ENST00000578552 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.81■■□□□ 1.88
GPS1-208ENST00000578552 IGF1RP08069 1367 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-208ENST00000578552 EEA1Q15075 1411 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-208ENST00000578552 GRIN2BQ13224 1484 aa26.7■■□□□ 1.86
GPS1-208ENST00000578552 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.69■■□□□ 1.86
GPS1-208ENST00000578552 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.69■■□□□ 1.86
GPS1-208ENST00000578552 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.68■■□□□ 1.86
GPS1-208ENST00000578552 PRXQ9BXM0 1461 aa26.65■■□□□ 1.86
GPS1-208ENST00000578552 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.63■■□□□ 1.85
GPS1-208ENST00000578552 ADAMTS12P58397 1594 aa26.63■■□□□ 1.85
GPS1-208ENST00000578552 KIF21BO75037 1637 aa26.62■■□□□ 1.85
GPS1-208ENST00000578552 CUL7Q14999 1698 aa26.62■■□□□ 1.85
GPS1-208ENST00000578552 GOLGA3Q08378 1498 aa26.53■■□□□ 1.84
GPS1-208ENST00000578552 FBLN2P98095 1184 aa26.52■■□□□ 1.84
GPS1-208ENST00000578552 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
GPS1-208ENST00000578552 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.51■■□□□ 1.83
GPS1-208ENST00000578552 CHD1O14646 1710 aa26.49■■□□□ 1.83
GPS1-208ENST00000578552 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GPS1-208ENST00000578552 SYNJ2O15056 1496 aa26.45■■□□□ 1.82
GPS1-208ENST00000578552 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GPS1-208ENST00000578552 GRIN2AQ12879 1464 aa26.42■■□□□ 1.82
GPS1-208ENST00000578552 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GPS1-208ENST00000578552 CEP170Q5SW79 1584 aa26.36■■□□□ 1.81
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