RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623691.3

GPS1-226, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene GPS1, Length 1,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-226ENST00000623691 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.55■■■■□ 3.6
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GPS1-226ENST00000623691 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
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GPS1-226ENST00000623691 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.79■■■□□ 2.52
GPS1-226ENST00000623691 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.66■■■□□ 2.5
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GPS1-226ENST00000623691 SMARCA2P51531 1590 aa28.59■■■□□ 2.17
GPS1-226ENST00000623691 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.57■■■□□ 2.16
GPS1-226ENST00000623691 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.57■■■□□ 2.16
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GPS1-226ENST00000623691 SYNJ1O43426 1573 aa27.31■■□□□ 1.96
GPS1-226ENST00000623691 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.25■■□□□ 1.95
GPS1-226ENST00000623691 SOGA1O94964 1423 aa27.24■■□□□ 1.95
GPS1-226ENST00000623691 EEA1Q15075 1411 aa27.2■■□□□ 1.94
GPS1-226ENST00000623691 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.16■■□□□ 1.94
GPS1-226ENST00000623691 TOP2BQ02880 1626 aa27.16■■□□□ 1.94
GPS1-226ENST00000623691 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.15■■□□□ 1.94
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GPS1-226ENST00000623691 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.87■■□□□ 1.89
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GPS1-226ENST00000623691 GOLGA3Q08378 1498 aa26.84■■□□□ 1.89
GPS1-226ENST00000623691 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.76■■□□□ 1.88
GPS1-226ENST00000623691 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-226ENST00000623691 CEP162Q5TB80 1403 aa26.73■■□□□ 1.87
GPS1-226ENST00000623691 WDR97A6NE52 1622 aa26.7■■□□□ 1.86
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GPS1-226ENST00000623691 CUX2O14529 1486 aa26.67■■□□□ 1.86
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GPS1-226ENST00000623691 KIF27Q86VH2 1401 aa26.66■■□□□ 1.86
GPS1-226ENST00000623691 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.66■■□□□ 1.86
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GPS1-226ENST00000623691 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.6■■□□□ 1.85
GPS1-226ENST00000623691 IFT140Q96RY7 1462 aa26.6■■□□□ 1.85
GPS1-226ENST00000623691 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.53■■□□□ 1.84
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GPS1-226ENST00000623691 IGF1RP08069 1367 aa26.46■■□□□ 1.83
GPS1-226ENST00000623691 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.46■■□□□ 1.83
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GPS1-226ENST00000623691 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.823e-8■□□□□ 10.6
GPS1-226ENST00000623691 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
GPS1-226ENST00000623691 CUL7Q14999 1698 aa26.35■■□□□ 1.81
GPS1-226ENST00000623691 HRCP23327 699 aa26.32■■□□□ 1.8
GPS1-226ENST00000623691 GRIN2BQ13224 1484 aa26.31■■□□□ 1.8
GPS1-226ENST00000623691 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.28■■□□□ 1.8
GPS1-226ENST00000623691 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.27■■□□□ 1.8
GPS1-226ENST00000623691 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GPS1-226ENST00000623691 ADAMTS12P58397 1594 aa26.22■■□□□ 1.79
GPS1-226ENST00000623691 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.21■■□□□ 1.79
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