Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL6Q02878 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL6Q02878 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL6Q02878 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL6Q02878 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms