Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YBX1P67809 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YBX1P67809 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YBX1P67809 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YBX1P67809 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YBX1P67809 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YBX1P67809 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YBX1P67809 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YBX1P67809 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YBX1P67809 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YBX1P67809 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YBX1P67809 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YBX1P67809 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YBX1P67809 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
YBX1P67809 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YBX1P67809 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX1P67809 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX1P67809 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX1P67809 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX1P67809 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX1P67809 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX1P67809 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX1P67809 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX1P67809 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX1P67809 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX1P67809 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX1P67809 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX1P67809 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX1P67809 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX1P67809 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX1P67809 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX1P67809 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX1P67809 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX1P67809 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX1P67809 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX1P67809 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX1P67809 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX1P67809 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX1P67809 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX1P67809 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX1P67809 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX1P67809 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX1P67809 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX1P67809 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX1P67809 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX1P67809 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
YBX1P67809 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX1P67809 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX1P67809 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX1P67809 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX1P67809 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX1P67809 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX1P67809 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX1P67809 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX1P67809 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX1P67809 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX1P67809 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX1P67809 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX1P67809 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX1P67809 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YBX1P67809 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBX1P67809 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YBX1P67809 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms