Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRPF1P55201 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BRPF1P55201 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms