Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP3M2P53677 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3M2P53677 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms