Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms