Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VEGFBP49765 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VEGFBP49765 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VEGFBP49765 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VEGFBP49765 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VEGFBP49765 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VEGFBP49765 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VEGFBP49765 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VEGFBP49765 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VEGFBP49765 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VEGFBP49765 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VEGFBP49765 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VEGFBP49765 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms