Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPAP49450 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPAP49450 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPAP49450 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPAP49450 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPAP49450 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPAP49450 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPAP49450 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPAP49450 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPAP49450 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPAP49450 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPAP49450 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPAP49450 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPAP49450 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPAP49450 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPAP49450 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPAP49450 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPAP49450 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPAP49450 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPAP49450 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPAP49450 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPAP49450 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPAP49450 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPAP49450 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPAP49450 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPAP49450 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPAP49450 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPAP49450 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPAP49450 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPAP49450 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPAP49450 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPAP49450 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPAP49450 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPAP49450 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPAP49450 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPAP49450 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPAP49450 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPAP49450 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPAP49450 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPAP49450 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms