Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG1BP48304 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
REG1BP48304 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
REG1BP48304 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
REG1BP48304 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
REG1BP48304 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
REG1BP48304 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
REG1BP48304 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
REG1BP48304 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
REG1BP48304 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG1BP48304 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG1BP48304 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
REG1BP48304 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
REG1BP48304 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
REG1BP48304 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
REG1BP48304 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
REG1BP48304 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
REG1BP48304 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
REG1BP48304 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
REG1BP48304 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG1BP48304 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG1BP48304 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG1BP48304 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG1BP48304 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG1BP48304 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG1BP48304 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG1BP48304 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG1BP48304 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG1BP48304 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
REG1BP48304 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
REG1BP48304 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
REG1BP48304 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
REG1BP48304 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
REG1BP48304 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
REG1BP48304 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
REG1BP48304 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
REG1BP48304 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
REG1BP48304 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG1BP48304 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
REG1BP48304 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REG1BP48304 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REG1BP48304 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms