Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PHKA1P46020 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHKA1P46020 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHKA1P46020 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHKA1P46020 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms