Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PSMC4P43686 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSMC4P43686 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC4P43686 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC4P43686 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms