Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC19A1P41440 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC19A1P41440 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC19A1P41440 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms