Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTRLP40313 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTRLP40313 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTRLP40313 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTRLP40313 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTRLP40313 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTRLP40313 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTRLP40313 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTRLP40313 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTRLP40313 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTRLP40313 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTRLP40313 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTRLP40313 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTRLP40313 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTRLP40313 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTRLP40313 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTRLP40313 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTRLP40313 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTRLP40313 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTRLP40313 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTRLP40313 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CTRLP40313 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTRLP40313 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTRLP40313 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTRLP40313 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTRLP40313 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTRLP40313 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTRLP40313 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTRLP40313 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTRLP40313 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTRLP40313 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTRLP40313 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTRLP40313 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTRLP40313 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTRLP40313 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTRLP40313 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTRLP40313 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTRLP40313 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTRLP40313 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTRLP40313 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTRLP40313 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms